يرأس مكتب الاعتماد وضمان الجودة عضو هيئة تدريسية يعينه رئيس الجامعة مديراً لهذا المكتب، ويتكون المكتب من سكرتاريا ومراسل وطاقم تنفيذي (يتم تحديد عدد أعضائه حسب الحاجة).و يتبع المكتب رئيس الجامعة مباشرة، وتكون مهمات المكتب:
  1. يكون مدير المكتب عضوا في اللجنة العليا لضمان الجودة، يرفع لها التقارير ويتلقى منها التعليمات. 
  2. يشارك مدير المكتب في عرض قضايا الجودة في مجلس الجامعة، ومجلس العمداء، والمجالس الرسمية في الجامعة، و مناقشتها. 
  3. يعد المكتب وثائق الجودة وإجراءاتها ونماذجها، وينسب بها الى اللجنة العليا لضمان الجودة بهدف اعتمادها. 
  4. يتابع مكتب الاعتماد وضمان الجودة تنفيذ الإجراءات، والالتزام باستخدام النماذج في الكليات والأقسام الأكاديمية، وفي الدوائر والمراكز الإدارية والمساندة في الجامعة و العاملين فيها. 
  5. ينسب مكتب الاعتماد وضمان الجودة بتشكيل اللجان التنفيذية المتخصصة لتحقيق أهدافه و مهماته، ومن هذه اللجان: 
    • اللجنة التنفيذية لضمان الجودة/ أكاديميا
    • اللجنة التنفيذية لضمان الجودة/ إداريا 
  6. يشرف على عمل اللجان التابعة له،ويصدر لها التعليمات ويتلقى منها التقاير، ر ويحتفظ بسجلاتها وبياناتها. 
  7. يدعو لاجتماعات اللجان التنفيذية التابعة له ، ويحتفظ بمحاضر اجتماعاتها، وينسق فيما بينها عند الحاجة لذلك. 
  8. يعد التقرير السنوي للجامعة. 
  9. يعد الخطة السنوية للجامعة. 
  10. يعد الخطة الاستراتيجية للجامعة. 
  11. يشرف على متابعة الإجراءات التصحيحية، بهدف التطوير المستمر للأداء في الجامعة. 
  12. يقوم بالاستعانة باللجان التنفيذية التابعة له بإعداد دراسة التقييم الذاتي السنوية ، بهدف تقييم الأداء في الجامعة. 
  13. يعمل على نشر ثقافة الجودة في الجامعة، من خلال اللقاءات والمنشورات والدراسات المتخصصة. 
  14. ينسب بالجوائز وشهادات التقدير للمتميزين والعاملين والمبدعين في مجال الجودة في الجامعة.