يتكون الهيكل التنظيمي للمكتبة من 5 شعب رئيسية كما يلي:

1- شعبة التزويد

وهي الشعبة المسؤولة عن تزويد المكتبة بمصادر المعلومات (الكتب) الورقية والإلكترونية وبكافة أنواعها مثل الموسوعات والمعاجم وغيرها من أشكال الكتب اللازمة للعملية التعليمية الأكاديمية ومتطلبات البحث العلمي ودعم كافة البرامج الأكاديمية وتحديث هذه المصادر وفق متطلب الإعتماد العام والخاص ومعايير الجودة المحلية والعالمية .

2- شعبة المعالجة الفنية

هي الشعبة المسوؤوله عن العمليات الفنية لمصادر المعلومات اللازمة لعمليات الحفظ والإسترجاع وفق المعايير والخطط والبرامج الدولية المعتمدة في الجامعة .

3- شعبة المجموعات العامة والخاصة والمراجع

تتكون الشعبة من 6 قاعات مطالعة كبيرة (قاعات الكتب (العربية1 +العربية2 +الأجنبية)) وقاعة المراجع وقاعة المجموعات الخاصة وقاعة الندوات، حيث تقوم بخدمة تدريب المستفيدين وإرشادهم إلى كيفية استخدام المكتبة استخداماً واعياً ينمي لديهم مهارات الوصول للمعلومات التي يحتاجونها في أبحاثهم ودراساتهم في المصادر الورقية والمطبوعة كما تقدم خدمة الإرشاد الجماعي للطلبة في قاعة المراجع، وتستخدم قاعة الندوات لتنظيم حلقات النقاش وورش العمل والمحاضرات الأكاديمية وهي مزودة بجهاز حاسوب وجهاز عرض البيانات Data Show Projector ووايت بورد وسماعات وميكروفون.

4-  شعبة الإعارة

هي المسؤولة عن تقديم كافة خدمات الإعارة والإرجاع والحجز وتنظيم هذه العمليات وفق البرمجيات المتاحة وتطوير هذه العمليات والتواصل المستمر مع مجتمع الباحثين ونقل آرائهم ومقترحاتهم وتقييمهم لمستوى الخدمات المكتبية .

5-  شعبة قواعد البيانات والدوريات

حيث تضم قاعة الدوريات على أعداد الدوريات الورقية الجارية بالإضافة الى الدوريات المجلدة للسنوات السابقة وقاعة مطالعة كبيرة بالإضافة الى أجهزه حاسوب متصلة بالإنترنت وقواعد البيانات الالكترونية الخاصة         بالجامعة.

ومختبر قواعد البيانات والذي يضم أجهزة حاسوب متصلة بقواعد البيانات الالكترونية وطابعة ليزرية عدد 2 وملونة 1 وجهاز سكانر لخدمة رواد المكتبة ويقوم المختبر بتقديم خدمة طباعة الأبحاث، ونسخ البيانات على الوسائط الالكترونية، والإرشاد وطريقة البحث في المصادر الإلكترونية، وتطوير وتحديث صفحة المكتبة على الموقع الإلكتروني للجامعة.

ويستخدم المختبر برمجية EZproxy لإتاحة قواعد البيانات الخاصة بالجامعة للمستفيدين من خلال صفحة المكتبة من خلال الموقع الالكتروني للجامعة.